MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 45291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	T	6	6	28	33	0 %	100 %	0 %	0 %	385824948
2	NC_017477	A	7	7	46	52	100 %	0 %	0 %	0 %	385824948
3	NC_017477	TAA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824948
4	NC_017477	AAG	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
5	NC_017477	AAG	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
6	NC_017477	AGTA	2	8	358	365	50 %	25 %	25 %	0 %	385824948
7	NC_017477	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824948
8	NC_017477	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824948
9	NC_017477	A	6	6	600	605	100 %	0 %	0 %	0 %	385824948
10	NC_017477	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824948
11	NC_017477	TAG	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824948
12	NC_017477	A	6	6	682	687	100 %	0 %	0 %	0 %	385824948
13	NC_017477	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824948
14	NC_017477	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824948
15	NC_017477	A	6	6	879	884	100 %	0 %	0 %	0 %	385824948
16	NC_017477	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824948
17	NC_017477	CAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824948
18	NC_017477	A	7	7	1067	1073	100 %	0 %	0 %	0 %	385824948
19	NC_017477	AAG	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
20	NC_017477	ACT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824948
21	NC_017477	AAG	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
22	NC_017477	TTG	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824948
23	NC_017477	CA	3	6	1261	1266	50 %	0 %	0 %	50 %	385824948
24	NC_017477	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	385824948
25	NC_017477	AGC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824948
26	NC_017477	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017477	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017477	GT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017477	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017477	AT	3	6	1496	1501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017477	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017477	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017477	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824949
34	NC_017477	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824949
35	NC_017477	CTA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
36	NC_017477	GAT	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824949
37	NC_017477	GATC	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	385824949
38	NC_017477	A	7	7	1791	1797	100 %	0 %	0 %	0 %	385824949
39	NC_017477	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	385824949
40	NC_017477	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
41	NC_017477	ATT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
42	NC_017477	GTC	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824949
43	NC_017477	CAA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824949
44	NC_017477	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
45	NC_017477	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
46	NC_017477	TAG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824949
47	NC_017477	ACA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824949
48	NC_017477	TTGAAT	2	12	2324	2335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385824949
49	NC_017477	TC	3	6	2353	2358	0 %	50 %	0 %	50 %	385824949
50	NC_017477	TCT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824949
51	NC_017477	TAA	2	6	2391	2396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824949
52	NC_017477	GAA	3	9	2473	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824949
53	NC_017477	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
54	NC_017477	T	7	7	2705	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017477	A	6	6	2803	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017477	A	7	7	2842	2848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017477	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017477	AT	3	6	2917	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017477	AGA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017477	TCT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824950
61	NC_017477	GGT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824950
62	NC_017477	AGA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824950
63	NC_017477	GAAA	2	8	3036	3043	75 %	0 %	25 %	0 %	385824950
64	NC_017477	ATTT	2	8	3088	3095	25 %	75 %	0 %	0 %	385824950
65	NC_017477	TTGAA	2	10	3123	3132	40 %	40 %	20 %	0 %	385824951
66	NC_017477	GAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
67	NC_017477	ATTT	2	8	3233	3240	25 %	75 %	0 %	0 %	385824951
68	NC_017477	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	385824951
69	NC_017477	AATT	2	8	3282	3289	50 %	50 %	0 %	0 %	385824951
70	NC_017477	A	7	7	3379	3385	100 %	0 %	0 %	0 %	385824951
71	NC_017477	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
72	NC_017477	AATG	2	8	3436	3443	50 %	25 %	25 %	0 %	385824951
73	NC_017477	AGA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
74	NC_017477	AATT	2	8	3529	3536	50 %	50 %	0 %	0 %	385824951
75	NC_017477	T	6	6	3550	3555	0 %	100 %	0 %	0 %	385824951
76	NC_017477	CAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824951
77	NC_017477	A	6	6	3613	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	385824951
78	NC_017477	T	7	7	3633	3639	0 %	100 %	0 %	0 %	385824951
79	NC_017477	AGA	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
80	NC_017477	AT	3	6	3700	3705	50 %	50 %	0 %	0 %	385824951
81	NC_017477	A	6	6	3707	3712	100 %	0 %	0 %	0 %	385824951
82	NC_017477	T	6	6	3774	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	385824951
83	NC_017477	GAT	3	9	3809	3817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
84	NC_017477	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824951
85	NC_017477	A	8	8	3854	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	385824951
86	NC_017477	ACT	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824951
87	NC_017477	T	6	6	3922	3927	0 %	100 %	0 %	0 %	385824951
88	NC_017477	GAT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
89	NC_017477	ATC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824951
90	NC_017477	AGT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
91	NC_017477	TTA	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824951
92	NC_017477	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824951
93	NC_017477	CTG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824951
94	NC_017477	AGA	2	6	4237	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
95	NC_017477	GCA	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
96	NC_017477	TAAA	2	8	4260	4267	75 %	25 %	0 %	0 %	385824952
97	NC_017477	TAG	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
98	NC_017477	ACC	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824952
99	NC_017477	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824952
100	NC_017477	ATA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824952
101	NC_017477	ACGA	2	8	4428	4435	50 %	0 %	25 %	25 %	385824952
102	NC_017477	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
103	NC_017477	GTC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
104	NC_017477	TGG	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824952
105	NC_017477	CGG	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824952
106	NC_017477	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824952
107	NC_017477	GTA	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
108	NC_017477	GAAA	2	8	4695	4702	75 %	0 %	25 %	0 %	385824952
109	NC_017477	GTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
110	NC_017477	GAA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
111	NC_017477	TCGT	2	8	4785	4792	0 %	50 %	25 %	25 %	385824952
112	NC_017477	CGA	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
113	NC_017477	AAAG	2	8	4916	4923	75 %	0 %	25 %	0 %	385824952
114	NC_017477	AAG	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
115	NC_017477	TGA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
116	NC_017477	TTGCA	2	10	5055	5064	20 %	40 %	20 %	20 %	385824952
117	NC_017477	ACT	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824952
118	NC_017477	GAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
119	NC_017477	TGT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824952
120	NC_017477	AGACTA	2	12	5298	5309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824952
121	NC_017477	TCGA	2	8	5340	5347	25 %	25 %	25 %	25 %	385824952
122	NC_017477	TTG	2	6	5406	5411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824952
123	NC_017477	CTG	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
124	NC_017477	TTAT	2	8	5552	5559	25 %	75 %	0 %	0 %	385824952
125	NC_017477	GCAA	2	8	5614	5621	50 %	0 %	25 %	25 %	385824952
126	NC_017477	ATC	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824952
127	NC_017477	CT	3	6	5826	5831	0 %	50 %	0 %	50 %	385824952
128	NC_017477	AAGGT	2	10	5907	5916	40 %	20 %	40 %	0 %	385824952
129	NC_017477	CGA	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
130	NC_017477	AAC	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824952
131	NC_017477	TCG	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
132	NC_017477	AGG	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824952
133	NC_017477	CTT	2	6	6281	6286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824953
134	NC_017477	CGT	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824953
135	NC_017477	AAG	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824953
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137	NC_017477	ATCT	2	8	6474	6481	25 %	50 %	0 %	25 %	385824953
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391	NC_017477	T	7	7	16994	17000	0 %	100 %	0 %	0 %	385824962
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394	NC_017477	TTTTA	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_017477	AGA	2	6	17232	17237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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